Tornillos y genes se toma un descanso

Nuestro blog cierra sus puertas durante unas semanas, al menos hasta que entre el año nuevo. Aprovecharemos estos días para escribir nuevos posts sobre Biología sintética, genética, computación y todo lo que se nos ocurra. También estamos buscando colaboradores. Si estás interesado en estos temas y te gusta la divulgación no dudes en ponerte en contacto con nosotros a la dirección de correo tornillosygenes@gmail.com. ¡Un abrazo a todos!

tornillosygenes@gmail.com
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Desde Boston

¡Hola a todos!

Aquí estoy en el Hotel Sonesta para informar brevemente de cómo va todo por aquí.

Tuvimos la exposición hoy a las 12:00 (a las 18:00 allí), tras la presentación de Trieste. Finalmente expusieron Aida y David, que lo han hecho muy bien los dos; el turno de preguntas tampoco ha ido mal, los jueces han sido bastante buenos, no han hecho preguntas difíciles y parecían bastante satisfechos. Tras la charla nos hemos ido a comer al Lobby (como el año pasado) y luego a echarnos algunas fotos en el Gran Domo del MIT (subiremos algunas en breve).

Ahora estamos de descanso en el hotel,  nos quedaremos aquí hasta esta noche que tenemos fiesta en el Jillian (vamos, como el año pasado). El tiempo, frío como de costumbre, pero nada exagerado.

Os mandamos un abrazo muy fuerte por allí a todos, gañanes!

 

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Bioinformática projecto iGEM UPO-Sevilla (II)

En este post trata de los análisis realizados en el apartado de Foundational Advances de nuestro projecto FlashBacter. Concretamente, en el projecto de nuestro equipo UPO-Sevilla se han llevado a cabo dos trabajos en la parte de Foundational Advances: el kit de biobricks basado en el sistema de transposición de Tn7 y el software BioBrickCreator (dicho software será tratado en futuros posts). Sigue leyendo

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¿Por qué el ADN no tiene uracilo?

ARN y ADN comparten tres de los cuatro nucleótidos (citosina, guanina y adenina). Sólo uno los diferencia, la timina en el ADN y el uracilo en el ARN. ¿Un capricho de la naturaleza? ¿Quizás un accidente de la evolución que quedó “fosilizado” en algún momento y luego se ha mantenido así? Quizás, pero no es probable, ya que hay una explicación mucho mejor. Sigue leyendo

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La secuencia no lo es todo, hay que plegarse

Las proteínas son las principales herramientas moleculares de los seres vivos. Estas moléculas biológicas están compuestas de ladrillos básicos llamados aminoácidos, algunos de los cuales fabrica el organismo y otros se ingieren en la dieta. Una proteína no es más que una tira lineal de una media de 400 aminoácidos (a veces muchos menos, y otras muchos más), constituyendo lo que se denomina su estructura primaria. Sin embargo, las proteínas sólo son funcionales una vez que la molécula lineal se pliega en el espacio, constituyendo lo que se conoce como su estructura terciaria o 3D. Sigue leyendo

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Bacterias contra la desertificación

Dificultad Biológica: Dificultad Biológica: Fácil

Hoy os traemos este tema tan interesante, que además es el proyecto ganador de la fase regional europea del iGEM 2011 celebrada del 1 al 2 de octubre en Amsterdam. Este equipo es el Imperial College de Londres, formado por 9 alumnos y 7 profesores, y han participado con un proyecto que no sólo lleva una gran base científica sino también una gran preocupación ambiental. Este equipo también fue galardonado con el premio a la mejor wiki, premio que premia la calidad de su página web (http://2011.igem.org/Team:Imperial_College_London). Aquí os contaremos con más detalle cómo pueden las bacterias frenar un problema tan grave como la desertificación. Este es el proyecto “Auxin” del equipo Imperial College de Londres.


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Bioinformática Proyecto iGEM UPO-Sevilla 2011 (I)

¿Cómo puede ayudar la bioinformática al desarrollo de memorias biológicas? Esta es la pregunta que nos hicimos en el equipo UPO-Sevilla cuando se pensó que la bioinformática también debía y podía aportar su granito de arena a nuestro projecto. Pues bien, en el apartado de bioinformática del equipo UPO-Sevilla se ha intentado complementar y asistir la labor de cada uno de los sublaboratorios. De esta forma, la parte de bioinformática de nuestro projecto va totalmente ligada a los sistemas biestables desarrollados (biestable mejorado y epigenético). Sigue leyendo

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Igemeros en Amsterdam

Tras casi un año atareados de nuevo con el iGEM (muchos de nosotros repetíamos en el concurso por segundo año consecutivo), llegaba la hora de exponer los resultados en Amsterdam, capital de Holanda, concretamente en la Vrije Universiteit (Universidad Libre de Holanda).

Universidad Libre

Este año presentábamos un proyecto totalmente diferente al del año pasado. Ahora el objetivo no era aglomerar bacterias en torno a una diana, sino de optimizar un mecanismo genético llamado biestable, que le permite a las células alternar entre dos estados, como si interruptores se trataran. Para ello habíamos abordado el problema desde muchos puntos de vista diferentes, de forma que habíamos desarrollado nuevas herramientas, tanto informáticas como genéticas, modelos matemáticos, simulaciones y un largo etc. Como es costumbre en el iGEM, no había dado tiempo para concluir todo el trabajo que nos habíamos propuesto (el tiempo aquí es muy limitante ya que el único momento en el que los estudiantes estamos realmente libres es en verano, y se va en un vuelo), pero no íbamos, en absoluto, con las manos vacías. Sabíamos, por la experiencia del año pasado, que el trabajo que presentábamos era bueno y tenía opciones, así que allá íbamos. Sigue leyendo

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¡¡Misión cumplida!!

¡¡Sí señores!! ¡¡ El equipo UPO-Sevilla pasa a la final en el MIT!! Con medalla de oro y premio a mejor trabajo en Human Practices, gracias a nuestras visitas en los institutos, la visita a la feria de la ciencia y a este blog. ¡¡¡Hurra por todos!!! ¡¡¡ Volveremos en breve con más noticias y hablando sobre nuestra experiencia en Amsterdam!!!

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Por el poder del ATP

Dificultad Biológica: Dificultad Biológica: Fácil

Desde que éramos pequeños nos enseñaron que la molécula que almacena energía en la célula es el ATP y que actúa como un transportador de energía química que la libera cuando la célula lo requiere. Esto así dicho suena muy ambiguo, por lo complicado de imaginarse qué es “almacenar, transportar y liberar energía”. Así que, ¿cómo funciona el ATP?


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